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    "textoCompleto" => "<span class="elsevierStyleSections"><span id="sec0005" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0025">Introducci&#243;n</span><p id="par0005" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La pandemia de COVID-19 se ha caracterizado por oleadas c&#237;clicas de gran volumen de casos&#44; contactos estrechos y brotes&#46; Esto ha evidenciado las limitaciones de la vigilancia epidemiol&#243;gica&#44; que en Espa&#241;a estaba infradimensionada<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a>&#44; en particular sus sistemas de informaci&#243;n&#46; Durante la pandemia se desarrollaron herramientas para manejar datos y obtener indicadores de vigilancia epidemiol&#243;gica&#44; como los <span class="elsevierStyleItalic">dashboards</span><a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0060"><span class="elsevierStyleSup">2</span></a>&#46; Sin embargo&#44; no ha habido un desarrollo hom&#243;logo en epidemiolog&#237;a de campo&#46; Las herramientas disponibles han sido insuficientes para actuar &#225;gilmente en el manejo y la gesti&#243;n de casos&#44; contactos estrechos y brotes en situaciones de alta transmisibilidad comunitaria<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a>&#46;</p><p id="par0010" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En la ciudad de Barcelona&#44; este d&#233;ficit fue m&#225;s evidente durante la sexta ola de la COVID-19 &#40;2&#47;11&#47;2021 a 28&#47;3&#47;2022&#41;&#44; que afect&#243; particularmente al &#225;mbito escolar&#46; La incidencia acumulada en 14 d&#237;as en Barcelona en personas de 0 a 14 a&#241;os se mantuvo por encima de los 1000 casos por 100&#46;000 personas del 18&#47;12&#47;2021 al 20&#47;02&#47;2022<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0085"><span class="elsevierStyleSup">7</span></a>&#46; El pico fue de 11&#46;681 casos el 26&#47;01&#47;2022&#46; Durante la sexta ola&#44; el 12&#37; de las personas de 0-14 a&#241;os escolarizadas en Barcelona fueron positivas en COVID-19<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0065"><span class="elsevierStyleSup">3</span></a>&#46; Siguiendo la estrategia testeo-trazado-aislamiento-cuarentena &#40;TTAC&#41;<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0070"><span class="elsevierStyleSup">4</span></a>&#44; se actu&#243; r&#225;pidamente para identificar y gestionar brotes escolares de COVID-19&#46; Para detectar agrupaciones de casos&#44; se evidenci&#243; la necesidad de manejar de manera eficaz datos masivos diariamente<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0075"><span class="elsevierStyleSup">5</span></a>&#46;</p><p id="par0015" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Esta nota metodol&#243;gica expone el proceso de dise&#241;o&#44; desarrollo e implementaci&#243;n en 2021 de la herramienta inform&#225;tica Germina&#44; acr&#243;nimo de <span class="elsevierStyleItalic">Giny Epidemiol&#242;gic per a la Revisi&#243; Met&#242;dica i Notificaci&#243; d&#8217;Agrupacions de casos de Covid-19</span> &#40;Herramienta epidemiol&#243;gica para la revisi&#243;n met&#243;dica y notificaci&#243;n de agrupaciones de casos de COVID-19&#41;&#46; Germina fue concebida en la Ag&#232;ncia de Salut P&#250;blica de Barcelona &#40;ASPB&#41; para automatizar la detecci&#243;n y el seguimiento de agrupaciones de casos escolares de COVID-19 en la ciudad de Barcelona&#46;</p></span><span id="sec0010" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0030">Exposici&#243;n del m&#233;todo</span><span id="sec0015" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0035">Dise&#241;o e implementaci&#243;n</span><p id="par0020" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Para el desarrollo y la implementaci&#243;n de Germina se aplic&#243; la metodolog&#237;a SCRUM&#44; una estrategia para resolver problemas emergentes mediante el desarrollo de productos complejos&#46; La metodolog&#237;a SCRUM optimiza el tiempo y los recursos de las organizaciones&#44; y es especialmente &#250;til para equipos multidisciplinarios y flexibles&#46; Adem&#225;s&#44; garantiza la transferencia de los aprendizajes obtenidos durante el proceso<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0080"><span class="elsevierStyleSup">6</span></a>&#46; El dise&#241;o se adapt&#243; a las necesidades de vigilancia epidemiol&#243;gica en la ciudad y se comprobaron&#44; mediante un pilotaje inicial&#44; su correcto funcionamiento y su aplicabilidad&#46; Para facilitar su uso en epidemiolog&#237;a de campo&#44; Germina se desarroll&#243; como un c&#243;digo <span class="elsevierStyleItalic">do-file</span> estructurado en m&#243;dulos para ser ejecutado diariamente con el <span class="elsevierStyleItalic">software</span> STATA-15&#46;</p><p id="par0025" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Germina se concibi&#243; para la captura&#44; la armonizaci&#243;n&#44; la integraci&#243;n&#44; el almacenaje&#44; el an&#225;lisis y la visualizaci&#243;n de datos procedentes de m&#250;ltiples fuentes de informaci&#243;n&#58; el Registro COVID-19 y el Registro Central de Salud del Departament de Salut de Catalunya&#44; el Censo Escolar del Consorci d&#8217;Educaci&#243; de Barcelona&#44; indicadores ecol&#243;gicos del &#225;rea de residencia y el padr&#243;n de la ciudad de Barcelona de la Oficina Municipal de Datos del Ayuntamiento de Barcelona&#46; Estas fuentes de informaci&#243;n y las variables que inclu&#237;an <span class="elsevierStyleItalic">s</span>e describen en la <a class="elsevierStyleCrossRef" href="#tbl0005">tabla 1</a>&#46; Germina incluy&#243; las 327&#46;486 personas escolarizadas o con relaci&#243;n profesional con un centro educativo de Barcelona en el curso 2021-2022&#44; independientemente de su empadronamiento&#46; La poblaci&#243;n escolar estaba distribuida en 13&#46;504 grupos de convivencia estable &#40;GCE&#41; y 871 centros educativos&#46;</p><elsevierMultimedia ident="tbl0005"></elsevierMultimedia></span><span id="sec0020" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0040">Funcionamiento</span><p id="par0030" class="elsevierStylePara elsevierViewall">En primer lugar&#44; Germina importa los casos confirmados de COVID-19 diariamente del Registro COVID-19 &#40;<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#fig0005">Fig&#46; 1</a>&#41;&#46; Estos datos se armonizan e integran con los procedentes de las otras fuentes de informaci&#243;n&#44; incluyendo el centro de estudios y la informaci&#243;n geogr&#225;fica&#46; Para su integraci&#243;n&#44; para cada caso se genera en cada fuente un identificador &#250;nico y an&#243;nimo a partir de las variables comunes en las diferentes fuentes&#58; CIP&#44; DNI o NIE&#44; fecha de nacimiento y sexo&#46; Esto permite que Germina pueda buscar agrupaciones de tres o m&#225;s casos de COVID-19 en un mismo GCE en 14 d&#237;as consecutivos&#46; Germina asigna un identificador &#250;nico a cada agrupaci&#243;n y obtiene el n&#250;mero de casos totales&#44; desagregados por sexo&#44; por alumnado y personal&#59; estima la tasa de ataque&#44; identifica las fechas del primer y del &#250;ltimo caso&#44; y propone fechas de inactivaci&#243;n y cierre de un posible brote&#46; Germina almacena esta informaci&#243;n en un fichero temporal diario y seguidamente la compara con la almacenada el d&#237;a anterior&#44; lo que mantiene un repositorio actualizado de agrupaciones de casos escolares&#46; Las agrupaciones son valoradas por el Equipo de Vigilancia&#44; Control y Prevenci&#243;n de la COVID-19&#44; que las trata como sospechas de brote y confirma o descarta el v&#237;nculo epidemiol&#243;gico entre los casos&#46; Esta informaci&#243;n se reincorpora autom&#225;ticamente en Germina para actualizar el repositorio de agrupaciones y generar un listado actualizado de los brotes de COVID-19 en el &#225;mbito escolar&#46;</p><elsevierMultimedia ident="fig0005"></elsevierMultimedia><p id="par0035" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Adem&#225;s&#44; Germina calcula diariamente indicadores epidemiol&#243;gicos y de gesti&#243;n&#44; por casos&#44; agregados por GCE y escuelas&#44; por divisiones territoriales y globales&#46; Exporta los indicadores a diferentes tablas y genera autom&#225;ticamente un informe-resumen para las personas de la ciudad implicadas en la toma de decisiones&#46; Las tablas generadas por Germina se guardan en el servidor de la ASPB y alimentan un <span class="elsevierStyleItalic">dashboard</span> p&#250;blico<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0085"><span class="elsevierStyleSup">7</span></a> que contiene gr&#225;ficos y mapas interactivos&#44; y que permite descargar los datos de COVID-19 en la ciudad&#46;</p></span><span id="sec0025" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0045">Cuestiones &#233;ticas</span><p id="par0040" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los datos individuales son usados y tratados de acuerdo con las directrices del Reglamento General de Protecci&#243;n de Datos vigente&#46; Siguiendo la Ley 18&#47;2009&#44; del 22 de octubre&#44; de Salud P&#250;blica&#44; las bases de datos est&#225;n sometidas a requisitos especiales de protecci&#243;n y se mantienen en archivos propiedad de la ASPB&#46;</p></span></span><span id="sec0030" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0050">Resultados</span><p id="par0045" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Germina se desarroll&#243; en 3 semanas&#46; Conect&#243; cinco fuentes de informaci&#243;n diferentes&#44; con estructuras complejas&#46; Se ejecut&#243; diariamente e identific&#243; 7713 agrupaciones de casos en el &#225;mbito escolar en la ciudad de Barcelona entre enero y febrero de 2022&#44; coincidiendo con el pico de la sexta ola&#46; Gener&#243; cuatro repositorios de informaci&#243;n epidemiol&#243;gica de uso interno&#44; vinculados a un cuadro de mando&#44; y permiti&#243; la actualizaci&#243;n autom&#225;tica diaria de 12 indicadores clave en un <span class="elsevierStyleItalic">dashobard</span> p&#250;blico<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0085"><span class="elsevierStyleSup"><span class="elsevierStyleItalic">7</span></span></a>&#44; desde el cual se pueden descargar los datos&#46;</p></span><span id="sec0035" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0055">Aplicaci&#243;n pr&#225;ctica</span><p id="par0050" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Germina se concibi&#243; para poder aplicarse en otros &#225;mbitos de transmisi&#243;n de la COVID-19 y para poder replicarse con otras enfermedades de declaraci&#243;n obligatoria&#46; La estructura en m&#243;dulos de Germina y su programaci&#243;n en STATA favorecen que esta herramienta pueda aplicarse en la vigilancia epidemiol&#243;gica y el seguimiento de brotes epidemiol&#243;gicos&#46; Asimismo&#44; la configuraci&#243;n de Germina permite identificar agrupaciones de casos en otros &#225;mbitos&#44; como domicilios&#44; residencias geri&#225;tricas&#44; centros de trabajo&#44; actividades l&#250;dico-deportivas y &#225;reas territoriales&#46;</p><p id="par0055" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La herramienta tambi&#233;n se aplica en la generaci&#243;n y la visualizaci&#243;n de datos actualizados diariamente para la comunicaci&#243;n de informaci&#243;n sobre vigilancia de la salud p&#250;blica<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0090"><span class="elsevierStyleSup">8</span></a>&#46; Adem&#225;s&#44; la informaci&#243;n actualizada facilita la toma de decisiones basadas en la evidencia dirigidas a la reducci&#243;n de las desigualdades sociales en la distribuci&#243;n de la COVID-19<a class="elsevierStyleCrossRefs" href="#bib0095"><span class="elsevierStyleSup">9&#44;10</span></a>&#46;</p></span><span id="sec0040" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0060">Fortalezas y limitaciones</span><p id="par0060" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Germina automatiz&#243; procesos manuales&#44; optimizando as&#237; los recursos humanos&#46; Facilit&#243; el seguimiento de los brotes epidemiol&#243;gicos y permiti&#243; obtener indicadores en tiempo real y actualizar a diario la informaci&#243;n epidemiol&#243;gica&#46;</p><p id="par0065" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Sin embargo&#44; Germina no permite valorar el v&#237;nculo epidemiol&#243;gico entre casos&#46; Adem&#225;s&#44; es dependiente de la calidad&#44; la robustez&#44; la validez&#44; la continuidad y la periodicidad de las fuentes utilizadas&#46;</p></span><span id="sec0045" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0065">Conclusiones</span><p id="par0070" class="elsevierStylePara elsevierViewall">El mecanismo de captura&#44; armonizaci&#243;n&#44; integraci&#243;n&#44; almacenaje&#44; an&#225;lisis y visualizaci&#243;n de datos de Germina ha permitido la automatizaci&#243;n y la sistematizaci&#243;n de la identificaci&#243;n de agrupaciones de casos de COVID-19 en un contexto de alta demanda del sistema de vigilancia epidemiol&#243;gica de la ciudad de Barcelona&#46;</p><p id="par0075" class="elsevierStylePara elsevierViewall">La epidemiolog&#237;a de campo se fortalece gracias a sistemas de vigilancia robustos&#44; actualizados y flexibles<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0055"><span class="elsevierStyleSup">1</span></a>&#44; que permiten una vigilancia epidemiol&#243;gica eficaz<a class="elsevierStyleCrossRef" href="#bib0075"><span class="elsevierStyleSup">5</span></a>&#46; La gesti&#243;n innovadora de datos y la inteligencia epidemiol&#243;gica fundamentada en herramientas inform&#225;ticas&#44; como Germina&#44; es clave para abordar los retos presentes y futuros que puedan plantear las enfermedades transmisibles&#46;</p></span><span id="sec0055" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0070">Disponibilidad de bases de datos y material para r&#233;plica</span><p id="par0100" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Los datos est&#225;n a disposici&#243;n de las personas que los soliciten a la autora para correspondencia&#46;</p></span><span id="sec0060" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0075">Editor responsable del art&#237;culo</span><p id="par0105" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Carlos &#193;lvarez-Dardet&#46;</p></span><span id="sec0065" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0080">Contribuciones de autor&#237;a</span><p id="par0110" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Todas las personas autoras han contribuido en la formulaci&#243;n y el dise&#241;o del art&#237;culo&#46; L&#46; Forcadell-D&#237;ez&#44; N&#46; S&#225;nchez-Valdivia&#44; M&#46; Pi&#241;ero Casas&#44; M&#46; Pila&#44; A&#46; Reyes Segura y G&#46; P&#233;rez han contribuido en la conceptualizaci&#243;n&#44; el dise&#241;o y la implementaci&#243;n de Germina&#46; L&#46; Forcadell-D&#237;ez y N&#46; S&#225;nchez-Valdivia han desarrollado&#44; programado y validado el c&#243;digo de Germina&#46; L&#46; Forcadell-D&#237;ez&#44; N&#46; S&#225;nchez-Valdivia&#44; M&#46; Pi&#241;ero Casas&#44; M&#46; Pila&#44; A&#46; Reyes Segura y G&#46; P&#233;rez han realizado la escritura original del art&#237;culo&#46; Todas las personas firmantes han contribuido a su revisi&#243;n cr&#237;tica con importantes contribuciones intelectuales&#46; Todas las personas firmantes han aprobado la versi&#243;n final para su publicaci&#243;n&#46;</p></span><span id="sec0070" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0085">Agradecimientos</span><p id="par0115" class="elsevierStylePara elsevierViewall">A todas las personas que han apoyado el desarrollo de este trabajo&#44; especialmente al equipo del Programa de Vigilancia&#44; Control y Prevenci&#243;n de la COVID-19 de la Ag&#232;ncia de Salut P&#250;blica de Barcelona&#46;</p></span><span id="sec0075" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0090">Financiaci&#243;n</span><p id="par0120" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Ninguna&#46;</p></span><span id="sec0080" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><span class="elsevierStyleSectionTitle" id="sect0095">Conflictos de intereses</span><p id="par0125" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Ninguno&#46;</p></span></span>"
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        "resumen" => "<span id="abst0005" class="elsevierStyleSection elsevierViewall"><p id="spar0005" class="elsevierStyleSimplePara elsevierViewall">La pandemia de COVID-19 evidenci&#243; que la vigilancia epidemiol&#243;gica no dispon&#237;a de recursos para responder a los aumentos de casos ni a los brotes&#46; La alta transmisibilidad comunitaria entre la poblaci&#243;n escolar en la ciudad de Barcelona al inicio de la sexta ola tension&#243; la unidad de vigilancia de COVID-19 de la ciudad&#46; Mediante metodolog&#237;a SCRUM se desarroll&#243; e implement&#243; Germina&#44; una herramienta inform&#225;tica capaz de capturar&#44; armonizar&#44; integrar&#44; almacenar&#44; analizar y visualizar diariamente datos de m&#250;ltiples fuentes de informaci&#243;n&#46; Germina permite identificar agrupaciones de tres o m&#225;s casos escolares y calcular indicadores epidemiol&#243;gicos&#46; La implementaci&#243;n de Germina facilit&#243; la respuesta epidemiol&#243;gica a la sexta ola de COVID-19 en el &#225;mbito escolar en Barcelona&#46; Esta herramienta es aplicable a otros &#225;mbitos de exposici&#243;n y a otras enfermedades transmisibles&#46; El uso de herramientas inform&#225;ticas automatizadas&#44; como Germina&#44; mejora los sistemas de vigilancia epidemiol&#243;gica y apoya la toma de decisiones basada en la evidencia&#46;</p></span>"
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            "apendice" => "<p id="par0130" class="elsevierStylePara elsevierViewall">Se puede consultar material adicional a este art&#237;culo en su versi&#243;n electr&#243;nica disponible en <span class="elsevierStyleInterRef" id="intr0005" href="doi:10.1016/j.gaceta.2023.102321">doi&#58;10&#46;1016&#47;j&#46;gaceta&#46;2023&#46;102321</span>&#46;</p>"
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                  \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Fuente de informaci&#243;n&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Descripci&#243;n&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t" scope="col" style="border-bottom: 2px solid black">Principales variables&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Registro de casos de COVID-19 del Departament de Salut&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
                  \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n
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                  \t\t\t\t">Informaci&#243;n relativa a diagn&#243;stico&#44; estado inmunitario&#44; informaci&#243;n cl&#237;nica yencuesta epidemiol&#243;gica&#44; y censo de contactos estrechos&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Identificador individual anonimizado &#40;Id&#41;SexoFecha de nacimientoPresencia o ausencia de sintomatolog&#237;aFecha de inicio de s&#237;ntomasFecha de consulta m&#233;dicaFecha de diagn&#243;sticoPrueba diagn&#243;stica realizadaResultado de la prueba diagn&#243;sticaEstado vacunalFecha de administraci&#243;n de vacuna COVID-19 &#40;desglosado por n&#250;mero de dosis&#41;Vacuna administradaContacto estrecho de un caso confirmado previoVariables de la encuesta epidemiol&#243;gicaVariables del censo de contactos estrechos&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Registro Central de Salud del Departament de Salut&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Informaci&#243;n personal y sociodemogr&#225;fica&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Identificador individual anonimizado &#40;Id&#41;SexoFecha de nacimientoLugar de residencia &#40;direcci&#243;n&#41;&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Censo escolar del Consorci d&#8217;Educaci&#243; de Barcelona&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Informaci&#243;n de individuos vinculados a centros educativos&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Identificador individual anonimizado &#40;Id&#41;Centro educativo &#40;nombre e identificador&#41;Grupo de convivencia estable &#40;nombre e identificador&#41;Perfil &#40;alumnado&#44; personal docente&#44; personal externo&#41;Nivel &#40;educaci&#243;n infantil&#44; educaci&#243;n primaria&#44; educaci&#243;n secundaria&#44; educaci&#243;n posobligatoria&#44; otras ense&#241;anzas&#41;Localizaci&#243;n del centro &#40;direcci&#243;n&#44; c&#243;digo postal&#44; barrio&#44; distrito&#41;&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Padr&#243;n de la ciudad de Barcelona&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Localizaci&#243;n de la residencia &#40;direcci&#243;n&#44; c&#243;digo postal&#44; barrio&#44; distrito&#41;&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Oficina Municipal de Datos de Barcelona&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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                  \t\t\t\t">Indicadores ecol&#243;gicos del &#225;rea de residencia&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
                  \t\t\t\t</td><td class="td" title="\n
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                  \t\t\t\t">&#205;ndice de renta familiar disponible&#160;del barrio de residencia&nbsp;\t\t\t\t\t\t\n
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